曲日浩-多伦多大学

      这次暑期我参加了由清华生命科学学堂班和Toronto分子遗传学系所联合举办的暑期科研项目，在Dr. Michael Wilson实验室做的课题研究，参与开发分析Quant-seq的pipeline——一种新的基于Illumina高通量测序平台针对RNA 3’UTR区域的测序技术。3’UTR测序技术与其他相比其优势在于可以显著降低测序成本，同时可以精准地定位coding sequence终止位点。利用这一技术的研究成果证实了之前有极多的终止位点被错误注释， 包括但不限于将长片段UTR注释为非编码RNA，以及引入错误的truncation导致基因片段不完整。由于这一技术刚刚起步，有很多的分析手段亟需改进，比如由于测序手段本身的限制会出现一些假阳性的信号，如何从中剔除是一个比较大的技术难题。其次，测序本身的数据呈现可以采用Poisson模型或者Negative Binomial模型，由于alternative polyadenylation，同一基因会编码出具有不同3’ UTR的transcript isoform，如果仅仅将测序得到的数据map到基因组上，无疑会将不同的transcript信号堆叠在一起导致信息折损并且会极大地影响终止位点的判断。以上这些都是未来继续本课题研究的重要探索方向。 

      通过参加本次的暑期海外科研项目，我除了学习到了与课题本身相关的分析RNA-seq的技术，最重要的是亲身感受了海外实验室的科研氛围，以及学会在国外如何适应环境并且照顾好自己。整体来讲，我觉得首先还是要加强自己的英语交流能力，之前由于没有注意练习口语导致刚到那里的时候和实验室的师兄师姐交流起来有一定的困难，利用开始两周的时间逐渐调整了过来。其次就是在那里由于不能完全适应当地的饮食习惯而“被迫”自己学会了做饭，可以说这是一种必备的海外求学的生存技能。我们一同去Toronto的四位清华学堂班同学，还有来自北大和浙大的几位同学，最后一起邀请了Toronto的项目负责人Xi Huang和Chi Chung Hui教授聚餐，各自做了一道菜。两位华人教授和我们进行了深入的交流，分享他们对于当下科研环境的一些认识，也同时给我们提供了很多从事科研的宝贵经验。

      最后，还是要感谢这样一个无比难得的暑研机会，非常感谢学堂班与多伦多联合暑期项目的负责老师们的支持和指导，尤其是学堂班的刘栋老师和杨扬老师，Toronto的Xi Huang和Chi Chung Hui教授。其次要感谢Dr. Michael Wilson教授对我暑研的详细指导，以及Huayun师姐给我的细节建议，让我得以顺利地开展一系列实验，并且从中更加深入地理解了RNA-seq的处理思想。虽然只有短短的两个月的时间，但是足以为我之后的科研道路提供弥足珍贵的借鉴经验。我想对于未来选择科研环境来说，最重要的是要选择一个契合自己当下能力和符合科研兴趣的实验室，只有这样才能具备最佳的个人发挥的空间，有助于未来科研的深入开展和培养个人积极探索的科研态度。