崔潇月-剑桥大学
此次海外研修,我学到了很多东西:首先,我今年五月才从细胞生物学和遗传学转向生物信息学和计算生物学,还是一个新手。这次在Ahringer实验室做了两个月的生物信息学,掌握了许多生物信息学的基本技能,各种软件、平台的使用和一些有效的小技巧等等。技能当然并不是最主要的,我最大的收获还是体验了真正的生物信息学研究,明白了严肃的研究是什么样的。从问题和猜想的提出,到验证和得出结论,每一步的逻辑是怎样的,应当怎样设计途径去研究,选取怎样的方法······这些方面都是真正投入地做了一段时间严肃的研究才能学会的,是不能只通过课堂学习的。还有,实验室的师兄师姐们的工作时间效率非常高,午餐也是速战速决。如果聊天也常常在聊科学问题,平时调侃的段子都是和科学有关的。这样一来他们极少加班,每天很早就下班,和很多实验室里学生们工作一会就娱乐一会,晚上还要待到九点十点,却不是因为一整天都在工作不同。除此之外,师兄师姐们对各种研讨会、讲座、公开课等都很感兴趣,带我也一起经常去听。我最开始总是听一点就听不懂,到后来都可以参与大家的讨论。我感觉我进步了很多。
至于我自己的课题,结果而言是非常不错的。老师认为我们可以就此写一篇小文章。其实这个项目并不是一直顺利坐下来的。最开始在取DNA序列的时候就出现了一个巨大的bug,我的正链和反链错了一个碱基,就导致正链和反链的区别很大,学习出来的启动子结构大部分都富集在正链或者反链。这个bug让我浪费了一周多的时间。不过其实也不能算作浪费,因为首先学到了教训,以后就不会再犯同样的错误了,其次脚本大概可以改一改照搬。这个问题解决之后又出了一个问题,就是我花了三四周的时间偏离了自己本来想要研究的科学问题——是什么序列特征造成了转录的方向性。而我过分关注了启动子和增强子的差异,忘记了我其实想研究的是转录的方向性。不过其实在关注启动子和增强子差异的时候我对很多模式都做了文献调研,在后来研究转录方向性的时候也用到了。最后四周的时候,经师兄提醒我才想起来我们最初感兴趣的那个科学问题,不过这个时候动手去做就很快了,也做的很顺利。后来的三四周就很快做出了很好的成果。所以我感觉犯错误没有关系,不会是白犯的,你总能从中有所收获。这个项目做下来我对将来的科研更有信心了,我相信保持这样好的状态可以做得很不错。