2020年秋季学期第2次Journal Club

11月29日下午，学堂班举办了本学期第二次Journal Club。本次讨论的文献题目为“Human cohesin compacts DNA by loop extrusion”，报告的同学为周皓宇、蒋鹏、王一川、陈泊文、杨雨荻和沈相宜，指导老师分别为颉伟、刘栋和梁鑫老师。在Journal Club开始前，同学们认真阅读了文献并进行了相关思考，填写了Discussion work sheet，为讨论做了充足的准备。

在这篇文章中，作者利用单分子成像技术观察到了重组人cohesin-NIPBL复合体在体外通过extrude DNA环的方式compact DNA的过程，并根据实验结果提出了cohesin-NIPBL通过形成二聚体在两个方向上对称地extrude DNA环的模型。由于观察到高盐离子浓度对cohesin与DNA的结合有影响，而核小体的存在不会阻碍cohesin介导的DNA compaction，作者推测cohesin是通过nontopological interaction来介导的DNA环extrusion过程。

在本次活动中，颉伟老师先为同学们做了一个简短的关于DNA compaction研究历史及背景的介绍，然后同学们分散到三个教室听取六位主讲人对这篇文章的分享。分享结束后，同学们就这篇文章涉及的技术、数据的可信度及设计实验的思路展开了热烈的讨论，并提出了自己关于进一步探究cohesin的思考。在讨论过程中老师们也积极参与，从不同视角给出了自己的见解。刘栋老师还对主讲人的presentation skills进行了点评，为同学们未来的展示提供了非常宝贵的建议。