- 2025年春季学期第3次Journal Club
2025-09-07
- 2025年5月17日，生命学院学堂班举行本学期第3次JC活动。本次分享的文章为TIGR-Tas: A family of modular RNA-guided DNA-targeting systems in prokaryotes and their viruses，文章通讯作者为MIT的张锋教授，于2025年2月发表于Science。张王亿、李品豪、苏冠辰、关国然、陈泰羽、徐子涵为报告人，梁鑫老师指导。 本文从spCas9的RBD（RNA binding）结构域出发，找到转座子系统IS110作为其同源系统，然后再依据IS110转座酶中的NOP结构域在大量基因组和宏基因组数据中对含有此结构域的蛋白进行聚类，从而挖掘到TIGR-Tas系统。在基因组上，该系统由36nt的TIGR序列和邻近的Tas蛋白组成，其中TIGR序列包括固定序列和两段可变序列，可变序列可以与配对的DNA序列结合并招募Tas蛋白进行双链切割，产生粘性末端。该系统可以容忍一定的碱基错配、插入和缺失，在原核和真核细胞中都展现出一定的活性。研究者进一步... MORE
- 2025年春季学期第2次学术沙龙
2025-09-07
- 2025年4月19日，学堂班开展了本学期第2次学术沙龙活动，主题为动物抗病毒机制进化（Evolution of Animal Antiviral Mechanism）。本次的主讲人是张健维、吕宜时、张哲昊、黄婧雯、常昊然、邓睿琦、曾作为和袁嘉惠，樊昌奇、曹宜可、胡刘钰滨、胡豪杰和赵宗棋也进行了内容筹备；刘栋老师指导了本次学术沙龙。 同学们与刘栋老师讨论沙龙 在此次学术沙龙中，张健维先以引言开篇，系统阐述病毒作为进化驱动力、共进化与抗病毒机制演化关系、生物抗病毒机制分类及无脊椎到脊椎动物的两条演化主线；吕宜时和曹宜可主讲了RNAi机制，深入解析RNAi的通用抗病毒特性、核心因子Ago/Dicer/RdRP的进化起源和在线虫与节肢动物中的演化差异；接下来，张哲昊和胡刘钰滨聚焦于干扰素机制，分析了RNAi丢失与IFN出现的进化关联、IFN替代假说与RdRP丢失假说的争议以及IFN亚型... MORE
- 2025年春季学期第1次学术沙龙
2025-09-07
- 2025年3月22日，学堂班开展了本学期第1次学术沙龙活动，主题为生物数学建模（Mathematical Modeling in the Life Sciences）。本次的主讲人是李哲夫、万伯昀、吴泽钊、张家盈、李昂城、叶琳珊和杨闰渊，刘玥、田芯瑜、陈思岐、李思萱、李静怡和秦润冬也进行了内容筹备；周帆老师指导了本次学术沙龙，刘栋老师与梁鑫老师也参与到汇报与讨论中。 同学们与周帆老师进行讨论 在此次学术沙龙中，李哲夫以马尔萨斯模型、米氏方程为例，介绍了生物数学建模的基本观念。万伯昀和刘... MORE
- 2025年春季学期第2次Journal Club
2025-09-07
- 2025年4月20日，学堂班开展了本学期第2次Journal Club活动，共同探讨了宾夕法尼亚大学的宋洪军、明国莉教授所领导的工作，题为Brain-wide neuronal circuit connectome of human glioblastoma。该工作于2025年1月发表于Nature杂志上。本此的主讲人是郝庆安、姜智浩、王一鸣、戴晗霖、李晓宇、匡正，指导老师为米达老师。李珍老师与杨扬老师也参与到汇报与讨论中。 ... MORE
